El Templo de Isis, justo al norte del Teatro Grande, fue construido hacia el final del siglo II a.C. poco después de la nueva disposición del Foro Triangular y la reconstrucción del Gran Teatro y della Palestra Sannitica. Testimonio de la gran difusión del culto egipcio en el mundo romano son los objetos relacionados con el culto de Isis encontrados en las casas y tumbas de las ciudades vesuvianas que demuestran la difusión del culto en todos los estratos sociales.
El culto a la diosa Isis era buscado por Ptolomeo según I, el sucesor de Alejandro Magno en Egipto. El Templo, dañado por el terremoto del 62 DC, fue reconstruido casi por completo y se encontró en un excelente estado de conservación.
El acceso principal al Templo consiste en una escalera ubicada en el centro del frente. En la celda hay un podio completamente hueco para las estatuas de culto; en el momento de la excavación se encontraron dos cráneos humanos y otros objetos rituales.
El Templo de Isis data del siglo II aC, fue descubierto en 1764 y es el más importante de los edificios de culto en Pompeya. En el momento de la erupción de 79 d.C. de hecho, fue el único edificio público que se restauró completamente después del terremoto de 62 DC.
La mayor parte de un egipcio decoraciones sujetos que cubrían el porche por las paredes y las del medio ambiente en el lado oeste de la misma, se separaron en el siglo XVIII durante las excavaciones, se encuentra actualmente conservado en el Museo Arqueológico Nacional de Nápoles, junto con numerosas esculturas de mármol y en bronce encontrado en el complejo.
Originalmente construido en la isla de Filae, se reubicó por la construcción de la represa Aswan High Dam en la isla Agilika.
El templo de Isis y Serapis fue el punto focal de los cultos paganos en el 43 aC.